掛金から制度運営費を控除した保険料が、一般生命保険料控除（旧制度）の対象となります。

※個人年金保険料控除の対象ではありません。個人年金保険料控除は「年金給付のみを目的とした制度であること」「確定年金の場合ご加入者の基本年金受取開始年齢が60歳以上で年金の受取期間が10年以上であること」等、所得税法上の制限を契約全体で満たさないかぎり、適用されません。年金共済「ゆとりプラン」は、前記のような制限を満たしておりませんので、個人年金保険料控除は適用されません。